商业秘密行政复议与行政诉讼的关系如下：

第一，申请复议与提起诉讼的选择。当事人对市场监督管理部门作出的行政处罚决定不服的，可以申请行政复议，也可以直接提起行政诉讼。法律、法规规定应当先申请行政复议再提起行政诉讼的，从其规定。

第二，复议前置情形。目前，商业秘密行政案件一般不属于复议前置情形，当事人可以选择先复议或直接诉讼。

第三，复议程序。公民、法人或其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。

第四，诉讼程序。当事人对复议决定不服的，可以在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起诉讼；直接起诉的，应当在知道具体行政行为之日起六个月内提出。

张泽生律师建议，当事人应当根据案件具体情况选择合适的救济途径，必要时可以同时采取复议和诉讼两种救济手段。