母子公司是独立的法人主体，商业秘密在母子公司之间的流转需要明确的约定和管理：

母子公司商业秘密管理的要点：

1. 独立权利主体：母公司与子公司是独立的法人，各自的商业秘密分别归属于各自。

2. 内部许可：母公司将商业秘密许可子公司使用时，应当签订许可协议。

3. 保密义务：子公司对获许可的商业秘密承担保密义务。

典型情形分析：

1. 子公司使用母公司商业秘密：
– 应当签订内部许可协议
– 明确使用范围和方式
– 约定保密义务

2. 母公司使用子公司商业秘密：
– 同样需要明确权属
– 避免”混同”导致权利不清

典型案例：在某集团企业内部商业秘密纠纷案中，法院认定，虽然母公司与子公司存在关联关系，但商业秘密的权利归属应当根据实际研发投入和合同约定确定，不能因关联关系而混同。

张泽生律师建议：集团企业应当建立统一的商业秘密管理制度，明确母子公司之间的权利边界和使用规则，避免因管理混乱导致商业秘密权利不清。