商业秘密刑事案件中，检察机关可以依法作出不起诉决定，包括以下情形：

第一，法定不起诉（绝对不起诉）。犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者具有刑事诉讼法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。

第二，酌定不起诉（相对不起诉）。对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。

第三，证据不足不起诉。对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。

在商业秘密案件中，如果犯罪嫌疑人犯罪情节较轻，认罪态度良好，积极赔偿损失并取得权利人谅解，检察机关可能考虑作出酌定不起诉决定。

张泽生律师提醒，权利人作为被害人，有权向检察机关表达意见。如果不同意不起诉决定，可以向检察机关提出申诉，也可以向上一级检察机关申请复核。