商业秘密刑事案件中，控辩双方质证的规则包括：

第一，证据开示。开庭审理前，控辩双方可以相互交换证据材料，了解对方的证据情况。

第二，质证程序。法庭调查中，先由公诉人宣读起诉书，然后由被告人、辩护人进行质证。控辩双方可以对证人证言、鉴定意见、书证、物证等各类证据进行质证。

第三，质证内容。质证内容包括：证据的真实性、合法性、关联性；证据的证明力；证据之间的相互印证关系等。

第四，质证方式。控辩双方可以采用询问、质疑、辩论等方式进行质证。

张泽生律师建议，权利人及其诉讼代理人应当充分准备质证意见，对控方证据进行认真审查。