合作开发终止后，商业秘密归属需要根据合同约定和法律规定处理：

合同约定优先：

合作开发合同中通常会约定合作终止后技术成果的归属和处理方式。

无约定时的处理原则：

1. 已有成果归属：合作期间已经形成的技术成果，按照共有规则处理。

2. 各方使用权限：各合作方有权在一定范围内继续使用共有成果。

3. 保密义务继续：各方的保密义务不因合作终止而消灭。

张泽生律师建议：企业在签订合作开发合同时，应当约定合作终止后技术成果的处理方式，避免日后发生争议。