根据司法实践，仲裁仅适用于合同纠纷，侵犯商业秘密纠纷系侵权之诉，应当由具有管辖权的人民法院管辖。即使当事人之间存在仲裁协议，若该协议未明确约定商业秘密侵权纠纷提交仲裁，法院通常认定仲裁协议不能排除侵权纠纷的管辖。需要注意的是，若当事人之间存在保密协议或竞业限制协议，协议中可能约定仲裁条款，此时涉及违约责任的部分可能受仲裁条款约束，但涉及侵权责任的部分仍可由法院管辖。张泽生律师建议企业在起草保密协议时，应当明确约定争议解决方式，并区分违约责任与侵权责任的管辖规则，避免因管辖问题影响维权效率。