商业秘密与国家秘密是两种独立的法律制度，一般情况下，商业秘密权利人不能要求国家有关部门为商业秘密保密：

法律制度的独立性：

1. 定密权的法定性：国家秘密的定密权由法律授权的机关行使，权利人不能自行主张。

2. 保护依据不同：商业秘密依据《反不正当竞争法》保护，国家秘密依据《保守国家秘密法》保护。

特殊情况：

根据《科学技术保密规定》，涉及国家科学技术秘密的企业，可以向科技行政管理部门申请确定为国家科学技术秘密，从而获得更严格的保护。

张泽生律师建议：企业应当建立自主的保密管理体系，不能依赖国家有关部门为商业秘密保密。如需提升保护级别，可咨询是否符合国家科学技术秘密的条件。