商业秘密民事诉讼中，鉴定的申请程序如下：

第一，申请条件。当事人可以就查明事实的专门性问题申请鉴定，如商业秘密的非公知性鉴定、同一性鉴定、损失鉴定等。

第二，申请方式。当事人应当在举证期限内提出鉴定申请，说明鉴定事项、鉴定理由等。

第三，鉴定机构选择。双方当事人协商确定鉴定机构；协商不成的，由人民法院指定。

第四，鉴定费用。鉴定费用由申请人预交，最终由败诉方承担。

第五，质证程序。当事人可以对鉴定意见进行质证，申请重新鉴定的，应当说明理由。

张泽生律师建议权利人，如案件涉及技术问题，应当及时申请鉴定。