商业秘密民事诉讼中，证据保全的申请程序如下：

第一，申请条件。证据可能灭失或者以后难以取得的，或者证据由被申请人控制的，当事人可以申请证据保全。

第二，申请方式。当事人应当在诉讼过程中向人民法院递交证据保全申请书，说明申请理由、证据线索、保全内容等。

第三，裁定时间。人民法院接受申请后，情况紧急的，应当在四十八小时内作出裁定。

第四，保全措施。人民法院可以采取查封、扣押、录音、录像、复制、鉴定、勘验等方法保全证据。

第五，费用承担。证据保全申请人不预先交纳费用的，人民法院可以责令其交纳。

张泽生律师提醒，证据保全是固定证据的重要手段，权利人应当及时申请。