商业秘密刑事案件中，境外实施侵权行为的处理规则如下：

第一，管辖权。根据刑法规定，犯罪行为或者结果有一项发生在中华人民共和国领域内的，就认为是在中华人民共和国领域内犯罪。对于在境外实施侵犯商业秘密行为的，如果犯罪结果发生在境内，我国法院有管辖权。

第二，证据收集。境外证据的收集需要经过公证认证程序，或者通过司法协助途径获取。

第三，法律适用。境外的侵权行为，适用中国法律追究刑事责任，但法律另有规定的除外。

第四，跨境执法。对于在境外实施的侵权行为，可以通过国际司法协助途径追诉。

张泽生律师提醒，权利人如发现侵权行为涉及境外，应当及时收集证据，并向有关部门反映情况。